Es un museo pequeño, con cinco salas en las que se explica didácticamente la historia de los antepasados que vivieron en estas tierras, con piezas pre-incas, incas y coloniales, en su mayoría procedentes de las excavaciones efectuadas en el Koricancha durante el período 1992-1995. Los elementos que se pueden observar incluyen objetos arqueológicos hallados en su explanada, tales como cerámicos, objetos líticos y metalúrgicos, así como cráneos con trepanaciones y momias, instrumentos musicales, entre otros.